Curso básico para seleccionar el flujo de trabajo para la elaboración de librerías y secuenciación masiva acorde a las necesidades de cada proyecto. Durante este curso teórico-práctico el participante aprenderá los comados básicos de Linux para el pre-procesamiento de lecturas de secuenciación masiva. Se realizarán bitácoras bioinfomátcas compartidas entre usuarios facilitando el flujo de trabajo y revisión de los resultados de proyectos de secuenciación.
El
curso esta diseñado para que cualquier participante de
licenciatura con conocimientos básicos de biología molecular pueda
realizarlo.
Partiremos
desde las bases moleculares del ADN, continuando
con la comprensión de
direferentes librerías genómicas para que puedas distinguir entre
las aplicaciones de cada una y al final podras definir la mejor
estrategia
de secuenciación
para responder tu pregunta de interés. Durante el curso aprenderas
desde las bases para limpiar y pre-procesar secuencias de cualquier
tipo de librería. Aprenderás a trabajar en servidores, crearás y
realizarás análisis bioinformáticos desde bitácoras electrónicas
en línea. Al finalizar el curso habrás realizado ejercicios de
limpieza de lecturas, blast en servidores,
ensamblajes de transcriptomas con y sin genoma de referencia,
realizarás
anotaciones
con uniprot, incorporación de librerías a NCBI, y
creación
de bitácoras electrónicas.
Visión
Integrar los conocimientos básicos para plantear proyectos de secuenciación adecuados para lograr responder diferentes preguntas de investigación.
Misión
Formar recursos humanos con habilidades para plantear y manejar datos de secuenciación masiva.
Objetivo
El participante aprenderá a seleccionar el flujo de trabajo para la elaboración y secuenciación de librerías acorde a las necesidades de cada proyecto. Aprender los comandos básicos de Linux para el pre-procesamientoanálisis de lecturas de secuenciación masiva. Desarrollar bitácoras bioinformáticas compartidas entre usuarios facilitando el flujo de trabajo y la revisión de los resultados de proyectos de secuenciación.
Destinatarios
Dirigido a participantes de licenciatura, posgrado, investigadores, docentes interesados en realizar proyectos con lecturas de secuenciación masiva. Primer acercamiento a la tecnología de secuenciación masiva y su análisis bioinformático.
El participante deberá contar con computadora personal con cualquier sistema operativo y conexión de internet. La institución dará acceso al servidor del laboratorio de genómica y bioinformática de CIBNOR, en donde podrá realizar los ejercicios del curso, contará con acceso las 24 horas, las cuentas para ingresar al servidor son personales e intrasferibles, en caso de detectarse el mal uso del servidor, se suspenderá la cuenta.
Modalidad
CURSO 100% ONLINE con acceso las 24 h. No requiere asistencia presencial. El curso se realiza en la plataforma del CIBNOR (Moodle). Contarás con el acompañamiento de un facilitador experto en el contenido. Desarrollarás diversas actividades teórico-prácticas y aprenderás “haciendo” y reflexionando sobre tu experiencia. Te propondremos diferentes estrategias y herramientas de comunicación para generar una experiencia de aprendizaje significativo orientado a la aplicación en la práctica laboral, profesional o docente. Haremos un seguimiento personalizado de tu progreso y te orientaremos para que logres los objetivos de aprendizaje.
- CEProfesor: Cristina Escobedo
- CRProfesor: Crisalejandra Rivera Perez
- MVProfesor: María Guadalupe Veliz
